Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BTN2A2-201ENST00000352867 3241 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC2-203ENST00000392644 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012377.1-202ENST00000558675 4811 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF8-203ENST00000405154 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX25-201ENST00000263576 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT80-202ENST00000394815 3859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MATN2-201ENST00000254898 4106 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138889.1-203ENST00000530000 6593 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PI3-201ENST00000243924 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H3J-201ENST00000359303 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079834.1-201ENST00000414016 421 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM213AP1-201ENST00000418757 668 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019118.2-202ENST00000419347 416 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01503-201ENST00000423122 545 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IRD1P1-201ENST00000434721 680 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00106-202ENST00000434938 356 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090955.1-201ENST00000458338 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD10-201ENST00000459579 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL704P-201ENST00000478699 274 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL551P-201ENST00000480810 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL634P-201ENST00000485467 292 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091980.1-201ENST00000524262 288 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000757.1-201ENST00000534150 959 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC119868.1-201ENST00000579307 336 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1273H-201ENST00000612921 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.151-201ENST00000616313 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358613.2-201ENST00000624651 567 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RDM1-229ENST00000639942 420 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL20-201ENST00000209884 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms