Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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