Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF40O75150 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF40O75150 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF40O75150 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF40O75150 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF40O75150 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RNF40O75150 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RNF40O75150 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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RNF40O75150 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RNF40O75150 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF40O75150 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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