Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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TIMMDC1Q9NPL8 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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