Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
AP5B1Q2VPB7 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms