Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms