Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms