Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 MAPK10-316ENST00000641430 2285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 EFHC1-226ENST00000636954 2129 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRHP20396 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRHP20396 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms