Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ZNF548Q8NEK5 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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ZNF548Q8NEK5 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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ZNF548Q8NEK5 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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ZNF548Q8NEK5 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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ZNF548Q8NEK5 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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