Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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