Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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