Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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FOXQ1Q9C009 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXQ1Q9C009 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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