Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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SGCBQ16585 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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SGCBQ16585 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SGCBQ16585 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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