Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHD4Q14839 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms