Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TCIRG1Q13488 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TCIRG1Q13488 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
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TCIRG1Q13488 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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TCIRG1Q13488 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TCIRG1Q13488 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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