Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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