Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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