Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPN13Q12923 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPN13Q12923 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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