Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXD13P35453 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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