Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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COPS7AQ9UBW8 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COPS7AQ9UBW8 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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