Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CNGB1Q14028 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms