Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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