Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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MKRN3Q13064 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
MKRN3Q13064 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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