Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms