Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms