Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SYCP1Q15431 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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SYCP1Q15431 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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SYCP1Q15431 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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SYCP1Q15431 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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SYCP1Q15431 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SYCP1Q15431 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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