Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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