Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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