Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms