Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CLN3Q13286 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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