Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ZNF234-204ENST00000592437 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 HGF-209ENST00000457544 2249 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms