Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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