Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRMP28827 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRMP28827 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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