Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
C4BP0C0L5 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
C4BP0C0L5 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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