Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ERVV-2B6SEH9 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ERVV-2B6SEH9 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms