Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms