Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCAF1Q9Y4B6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
DCAF1Q9Y4B6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms