Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNND2Q9UQB3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms