Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNRF3Q9ULT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNRF3Q9ULT6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms