Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJD2Q9UKL4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJD2Q9UKL4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms