Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP8AP2Q9UKL3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms