Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAX2Q9UIW0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms