Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms