Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT172Q9UG01 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms