Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9Q9P2J2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms