Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPF2Q9P2E5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms