Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMG20BQ9P0W2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMG20BQ9P0W2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms