Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MIS18AQ9NYP9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIS18AQ9NYP9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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