Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CWC25Q9NXE8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms