Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCLQ9NW38 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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